Автор запутать пытается. Не забывайте что Нишизона Шинджи это целая программа. Его имплантировали в Тетору, пацана, а когда умер настоящий Амамия, в корабле, пробудился Шинджи Тетора, скажем так усовершенствованный. Натуральная личность мальчика в Шинджи сделала свой вклад. По факту тот самый повзрослевший Тетора, который Кито"помог" ( относительно ) и идет против организации Гакусо.